Bu tür tedavi ancak şişmanlığa bağlı hastalıkları olan ve çok aşırı kilolu hastalar için bir tedavi seçeneği olabilir.  Herkese uygulanacak yöntemler değildir. Mideye silikon bant koyma, mideyi küçültme ve mide ile bağırsak arasında bypass yapma gibi ameliyatlar yapılabilmektedir.

Cerrahi tedavi için uygun şişman kişiler şöyle tanımlanabilir:

• Vücut kitle indeksi  40 Kg/ m2’den fazla olmalıdır
• Şişmanlık en az 5 yıldır devam ediyor olmalıdır
• Diyet ve ilaç tedavisi başarısızlıkla sonuçlanmış olmalıdır
• Hasta ameliyat sonrası kontrol ve diyet programlarına uyum sağlayabilecek olmalıdır
• Hasta alkolik olmamalı veya başka bir önemli psikiyatrik bir hastalığı olmamalıdır
• Hasta 18-65 yaş arasında olmalıdır

Şişmanlarda cerrahi tedavi, çok aşırı kilolu ve kilo kaybı olmazsa büyük sağlık problemleri ile karşılaşacak hastalar için düşünülmelidir. Ameliyat sonrası takip çok önemlidir. İlk yıl her üç ayda bir, sonra yılda bir kontrol yapılır.